铁皮石斛榨出紫色的汁是受其品种和生长环境影响，一些特异的杂交品种会榨出紫色的汁或煮水是紫色的（如图），对口感和功效影响不大，可以放心食用，至于有些商家以紫汁为卖点大可不必在意。 铁皮石斛有一种红杆的品种，其表皮是紫色的，榨出的鲜汁一般也是鲜绿色的。有不少的人是买到紫皮石斛或者是杂交石斛才导致榨汁出现紫色，大部分的铁皮石斛榨汁都是草绿色的十分好看。 广南有一种全红的软脚铁皮石斛品种，其全身红杆叶子也是红的，榨出的汁也是紫红色的。
不少人购买的铁皮石斛煮水是紫色的
正常的铁皮石斛煮水是淡黄色，晶莹透彻。榨出的汁是草绿色，鲜甜可口，紫色的汤是买到杂交品种了。铁皮石斛在有些环境下生长，会长出特别的“锈斑”，榨汁或者泡水的时候会导致皮中的紫色色素到汤中，使汤变成紫色的。
广南软脚紫杆铁皮石斛
有的铁皮石斛表面有紫色的锈斑的原因
每年入冬之后，尤其在温度降到15度以下时，在大棚东、南、西侧，原来生长旺盛的铁皮石斛就会出现较多的紫色斑点，出现斑点的部位主要集中在茎的叶鞘部位、叶片的叶脉及叶缘附近，在叶鞘不完全包被的茎部则出现紫黑色的环，形成明显的黑节。
紫斑的形成是由于气温下降，石斛从快速生长期转到营养积聚期即所谓“长高期”转到“长胖期”后，其分解代谢变慢，而合成代谢继续维持在较高水平，有效成分积累快速增加，植株对光照的反应变得特别敏感所出现的一种紫外应急反应。
此时，在光照较强的部位，如大棚东、南、西侧或没有遮阳的部位，由于紫外光促进植物合成紫色色素“花色素苷”，并积聚在植物的特定部位，就出现了上述的紫斑和黑节特性。
在铁皮石斛组培苗栽培的初期，由于还没有进入“长高期”，生长基本在“长胖期”，即积累营养阶段，也往往出现明显的紫斑，这在铁皮石斛栽培中是适应环境并已成活的重要标志。
事实上，铁皮石斛的名称同紫斑有着密切的关系，这些紫斑粗看就象铁锈一样，俗称“铁锈斑”，集中在表面，就有了铁皮石斛的名称，而铁皮石斛的另一个名称“黑节草”也是由于叶鞘不完全包被的茎部的紫黑色“节”而来。紫斑和黑节也是铁皮石斛的重要分类特征之一，在强光下容易出现紫斑也是优质铁皮石斛品种的重要标志。
紫斑丰富的铁皮石斛，茎一般较硬实，汁水充足。经煎煮后，汤汁浓稠、呈富有活力的紫红色，一般认为其寒性较淡绿色汤汁稍小，不影响使用效果。