铁皮石斛种子育苗是野生环境生长中主要的繁殖方式，铁皮石斛果实成熟后，果荚裂开，种子随风飘到新的附主上，在适宜的条件下发芽生长。受自然环境限制，铁皮石斛种子繁殖方式，成活率非常低。 铁皮石斛种子繁殖需要其在开花期授粉充分，所以一般的种植户很少采用该方式， 种子繁殖一般用于组培育种技术中。铁皮石斛种子育苗即种子繁殖。种子繁殖须具备适宜温度、适中光照、足够的水分三个必要条件，缺一不可。目前，采用种子自然播种育苗的方法有拌鲜牛粪涂抹法、对水喷洒法、对米汤喷洒法、大棚配基质播种法和种子快速育苗的方法。
铁皮石斛种子快速育苗是借助高新技术手段，利用尚未充分成熟的铁皮石斛种子(蒴果尚未开裂)，经严格地消毒并在无菌的条件下植入培养基中。培育过程中分为扩繁期和育苗期，经60～80天的培养，待种子萌发显现小叶时，将其取出移植于另外的培养瓶中使其生长空间加大，待继代苗又长满培养瓶时，再进行扩繁，称为扩繁期；调整培养基配方，使其生根，称为育苗期；待根系发达，每株生长2～5根，根长2-5cm,株茎高4-8cm，取出到炼苗床上进行炼苗，待炼苗达到移栽大田种苗标准时(根系较发达)，即可移植于树上或基质上进行大田种植。
1.种子采集
(1)野外与室外人工种植留种地隔离带1000m范围内无其他种类石斛，大棚留种应在独立大棚内人工授粉。
(2)留种株应该选择品种特性纯正、生长健壮的植株。
(3)在5～6月盛花期进行授粉，母本在授粉后立即摘除唇瓣，及时挂牌标志。
(4)开花后6～8个月，选择饱满的果实采收。
2.种子处理
采收的蒴果应保存于4℃的冰箱中，用酒精(70%～75%)或净氯酸钠(1%)消毒10s后进行无菌播种。